N° thèse - Tel Archives ouvertes

N° ORDRE : 3783 THESE présentée devant l'Université de Rennes 1 pour obtenir le grade de DOCTEUR DE L'UNIVERSITE DE RENNES 1
Mention : BIOLOGIE
PAR Julien FOSSE
|Equipes d'accueil : |UMR Sécurité des Aliments et Microbiologie (SECALIM |
| |1014) |
| |UMR Bio-agression, Epidémiologie et Analyse de Risques |
| |(BIOEPAR 1300) |
| |Ecole Nationale Vétérinaire de Nantes - INRA |
|Encadrement : |Madame Catherine Magras, Maître de conférences |
| |Ecole Nationale Vétérinaire de Nantes - UMR SECALIM |
| |1014 |
|Ecole doctorale : |Vie-Agro-Santé |
|Composante |Sciences de la Vie et de l'Environnement |
|universitaire : | |
Valeur informative d'indicateurs
ante et Post mortem pour la détection des dangers biologiques pour le
consommateur de viande porcine
SOUTENUE LE 1er DECEMBRE 2008 DEVANT LA COMMISSION D'EXAMEN
Composition du jury : |Rapporteurs : |Madame Christine Vernozy-Rozand, Professeur |
| |Ecole Nationale Vétérinaire de Lyon, URSP Microbiologie |
| |Alimentaire et Prévisionnelle |
| | |
| |Monsieur Francis Mégraud, Professeur |
| |Université Victor Segalen Bordeaux 2, UFR Sciences Médicales|
| |3 - INSERM, U 853 |
| | |
|Examinateurs : |Madame Gwennola Ermel, Professeur |
| |Université de Rennes 1, UFR Sciences de la Vie et de |
| |l'Environnement - CNRS, UMR 6026 ICM |
| | |
| |Madame Régine Talon, Directrice de recherches |
| |INRA, Centre de Clermont-Theix, UR 370 Microbiologie |
| | |
| |Monsieur François Madec, Ingénieur de recherches |
| |AFSSA, Laboratoire de Ploufragan,UR EBEP |
| | |
|Directeur de |Monsieur Henri Seegers, Professeur |
|thèse : |Ecole Nationale Vétérinaire de Nantes - INRA, UMR 1300 |
| |BIOEPAR |
Remerciements
A Madame Christine Vernozy-Rozand
Professeur de l'Ecole Nationale Vétérinaire de Lyon
Directrice de l'URSP Microbiologie Alimentaire et Prévisionnelle A Monsieur Francis Mégraud,
Professeur de l'Université Victor Segalen Bordeaux 2, UFR Sciences
Médicales 3
Directeur de l'Unité INSERM 853 Infections à Helicobacter, Inflammation et
Cancer Pour avoir accepté d'être rapporteurs de cette thèse,
Nous leur exprimons notre profonde gratitude.
A Madame Gwennola Ermel
Professeur de l'Université de Rennes 1, UFR Sciences de la Vie et de
l'Environnement
UMR CNRS-Université de Rennes 6026 Interactions cellulaires et moléculaires A Madame Régine Talon
Directrice de recherches de l'Institut National de Recherche Agronomique
Directrice de l'Unité de Recherches 370 Microbiologie, centre de Clermont-
Theix A Monsieur François MADEC
Ingénieur de recherches de l'Agence Française de Sécurité Sanitaire des
Aliments
Responsable de l'Unité de Recherches Epidémiologie et Bien-Etre du Porc,
laboratoire de Ploufragan
Pour avoir accepté de participer à ce jury de thèse en tant
qu'examinateurs,
Nous leur exprimons nos remerciements les plus sincères.
A Monsieur Henri Seegers,
Professeur de l'Ecole Nationale Vétérinaire de Nantes
Directeur de l'UMR INRA-ENVN 1300 Bio-Agression, Epidémiologie et Analyse
des Risques Pour avoir accepté de diriger cette thèse,
Pour les conseils prodigués durant sa réalisation.
Ce travail n'aurait pu être réalisé sans le soutien financier du Ministère
de l'Agriculture et de la Pêche et l'appui des éleveurs et des abatteurs
qui nous ont ouvert leurs portes. Nous leur exprimons ici notre profonde
gratitude. Cette thèse a été menée à l'Ecole nationale vétérinaire de Nantes, au sein
de l'UMR ENVN-INRA- Sécurité des Aliments et Microbiologie (SECALIM), en
collaboration avec l'UMR ENVN-INRA
Bio-Agression, Epidémiologie et Analyses des Risques (BIOEPAR). Nous tenons plus particulièrement à présenter nos remerciements à :
Madame Catherine MAGRAS
UMR ENVN-INRA Sécurité des Aliments et Microbiologie (SECALIM) Pour avoir encadré ce travail au quotidien,
Pour son investissement personnel, déterminant quant au règlement des
difficultés rencontrées,
Pour son attachement à voir développée une recherche finalisée
interdisciplinaire de qualité. Monsieur Albert ROSSERO
UMR ENVN-INRA Sécurité des Aliments et Microbiologie (SECALIM) Pour sa disponibilité constante et son appui à la résolution des problèmes
techniques,
Pour nous avoir apporté son aide lors de la campagne de prélèvements
Pour son appui à la réalisation des analyses de biologie moléculaire et de
bactériologie. Monsieur Michel LAROCHE
UMR ENVN-INRA Sécurité des Aliments et Microbiologie (SECALIM) Pour l'aide apportée à la campagne de prélèvements et à la réalisation des
analyses,
Pour nous avoir apporté ses conseils et son expertise en biostatistique. Monsieur Nicolas OUDOT
Unité d'Hygiène et Qualité des Aliments, ENVN Pour l'appui apporté à la campagne de prélèvements et d'analyses,
Pour son sens de l' organisation,
Pour son humilité, une qualité en voie de disparition. Madame Pascale GILLI-DUNOYER
Ministère de l'Agriculture et de la Pêche, Direction générale de
l'Alimentation Pour avoir soutenu ce projet lors de sa conception en 2004,
Pour nous avoir permis d'obtenir les financements publics indispensables à
l'aboutissement de ce travail.
Madame Janine FORESTI
Unité d'Hygiène et Qualité des Aliments, ENVN Pour l'aide apportée au règlement des difficultés logistiques et
administratives,
Pour l'élégance de ses silences.
Mademoseille Nabila HADDAD
UMR ENVN-INRA Sécurité des Aliments et Microbiologie (SECALIM) Pour l'appui technique apporté à la campagne de prélèvements,
Pour son énergie et ses qualités humaines.
Madame Françoise ARMAND
UMR INRA-ENVN Bio-Agression, Epidémiologie et Analyses des Risques
(BIOEPAR) Pour nous avoir apporté son aide lors de la campagne de prélèvements en
abattoir,
Pour l'appui technique aux analyses bactériologiques et de biologie
moléculaire.
Monsieur Jean-Yves AUDIART
UMR INRA-ENVN Bio-