Cours # 1 Mesures de la fréquence des maladies et associations

Cours d'épidémio #1
Mesures de la fréquence des maladies et associations
Objectifs du cours :
- Définir et savoir calculer : incidence, prévalence, taux
- Savoir calculer et connaître les avantages et inconvénients des
ratio de cote, risque relatif, risque attribuable.
À lire:
| |
- Barbara W. Trautner, MDa,bet al., Prospective Evaluation of the
Risk of Serious Bacterial Infection in Children Who Present to the
Emergency Department With Hyperpyrexia (Temperature of 106°F or
Higher) PEDIATRICS Vol. 118 No. 1 July 2006, pp. 34-40.
http://pediatrics.aappublications.org/cgi/reprint/118/1/34
Exercices pratiques à faire avant le cours. Il s'agit d'exercices qui
serviront de point de départ pour les discussions. Question #1
Selon vous laquelle des 2 entités suivantes a la prévalence la plus
élevée : le pulled elbow ou la fracture du fémur ? Pourquoi ?
Question #2
Faites la démonstration mathématique que OR=RR si la maladie est rare. Question #3
Dans un petit village de 20 000 personnes, il y avait 100 personnes sous
traitement pour cancer du testicule et 1000 sous traitement pour cancer de
la prostate en 1998. Au cours des 5 années subséquentes, le médecin du
village a diagnostiqué 18 nouveau cas de cancer du testicule et 20 cancer
de la prostate. Laquelle des 2 maladies a l'incidence la plus élevée dans
ce village et pourquoi?
Question #4
Si on sait que la prévalence d'une maladie X est de 10 cas / 1 000
personnes et on sait que son incidence est de 5 nouveaux cas / 1 000
personnes à risque par année, peut-on estimer la durée moyenne de la
maladie ? Question #5
Voici des tables donnant les taux de mortalité selon les âges pour 2 pays
très différents. | |Pays A | | |Pays B | |
|Age |Taux |populatio| |Taux mortalité /|populatio|
| |mortalité / |n | |100 000 pers |n |
| |100 000 pers| | | | |
|0-1 ans |100 |10 000 | |200 |3 000 |
|1-5 ans |20 |30 000 | |40 |7 000 |
|5-10 ans |10 |30 000 | |20 |30 000 |
|10-18 ans |5 |30 000 | |10 |60 000 |
|total |20.5 |100 000 | |20.8 |100 000 | Comment expliquer que les taux de mortalité totaux sont similaires pour des
populations de tailles similaires malgré le fait que pour chaque catégorie
d'âge, le taux de mortalité est 2 fois plus élevé dans le pays B que le
pays A ? Question #6
Voici un tableau construit à partir d'une étude prospective
| |Maladie + |Maladie - |Total |
|Facteur de risque|20 |80 |100 |
|+ | | | |
|Facteur de risque|10 |90 |100 |
|- | | | |
|Total |30 |170 |200 | Quel est le risque relatif de développer la maladie chez les gens exposé ? Quelle est la différence de risque ? Qu'est-ce que ça veut dire ? Quelles en sont les implications ? Quel est le odds ratio ? Voici le même tableau construit sur le même sujet à partir d'une étude cas-
témoin. | |Maladie + |Maladie - |Total |
|Facteur de risque|20 |10 |30 |
|+ | | | |
|Facteur de risque|80 |90 |170 |
|- | | | |
|Total |100 |100 |200 | Quel est le risque relatif de développer la maladie chez les gens exposé ? Quel est le odds ratio ? Quelle est l'explication ? Question #7
Supposons que les cancers A et B sont tout aussi méchant et mortels. Si
vous savez que la prise d'estrogène par les femmes ménopausées diminue le
risque du cancer A de 25% mais il augmente le risque du cancer B de 75%,
quelle autre donnée concernant les cancers A et B vous sera nécessaire
avant de faire des recommandations face à l'utilisation d'estrogène ? Question #8
Quels sont les avantages du risque relatif ?
Quels sont les avantages du odds ratio ?
Question #9
Un médecin a développé un nouveau médicament qui permet aux gens atteint de
cancer des os de vivre 9 mois de plus avec une bonne qualité de vie. Avant
cette nouvelle médication, l'espérance de vie au moment du diagnostic était
de 18 mois. Malheureusement, cette nouvelle médication est associée à une
hausse de la prévalence de la maladie de 50%. Est-ce que vous utiliseriez
ce médicament dans votre pratique ? Expliquez. Question # 10 Dans l'article de Trautner : Doit-on dire l'incidence ou la prévalence d'hyperthermie (hperpyrexia)?
Quelle est l'incidence/prévalence d'hyperthermie dans leur population ?
Quelle est la prévalence de bactériémie parmi leurs patients avec
hyperpyrexie ?
Les auteurs disent que tous les patients avec hyperthermie furent inclus
dans l'étude. Est-ce une bonne affaire et pourquoi ?
Quelle est l'utilité de la FSC dans leur étude ? Cours # 1 Mesures de la fréquence des maladies et associations L'épidémiologie consiste en la description et l'étude de la distribution
des maladies et de leurs facteurs associés. Pour ce faire la première étape
consiste à déterminer la fréquence de la maladie. 1. Mesures de fréquence
Quantifier une pathologie consiste à compter le nombre de personnes
atteintes de la pathologie. C'est une donnée est utile pour évaluer les
ressources nécessaires. Si l'on veut comparer l'occurrence de la maladie
dans diverses populations ou situations, il faut par contre avoir plus
d'information. La taille de la population à risque est une donnée
primordiale au calcul de la prévalence d'une maladie(dénominateur). Il
existe 3 types de paramètre mathématique permettant de décrire la relation
entre le numérateur et le dénominateur :
- Une cote (odds) est obtenue en divisant le nombre de cas de la maladie
ou condition X par le nombre de cas n'ayant pas la maladie ou la
condition X. Il s'agit donc d'un ratio de 2 probabilités. On dira par
exemple que dans les cas d'un traumatisme de la cheville on retrouve 2
patients avec fracture pour 8 patients avec une lésion des tissus mous
dont une cote de 2:8 ou 1:4. Ce paramètre est plus difficile à
conceptualiser mais il est utile au point de vue statistique pour des
raisons mathématiques. Il est donc utilisé fréquemment même s'il n'est
pas instinctif de parler en terme de cote.
- Une proportion ressemble à un ratio mais le dénominateur contient tous
les cas et les non-cas (donc tous les participants). On peut aussi
parler de risque. On dira par exemple 2 patients avec fractures sur
les 10 patients avec traumatisme de la cheville. Le risque de fracture
parmi les enfants avec traumatisme de la cheville est de 20%.
- Un taux est une mesure d'association où le dénominateur contient aussi
une dimension temporelle. On dira par exemple que le taux d'IVRS est
en moyenne de 2 rhumes par enfant par année. On peut toujours transformer une cote en risque et vice-versa. Pour ce
faire, on utilise la formule : Cote = risque / (1-risque) et
risque = Cote / (1+ cote) La prévalence d'une maladie est définie par le nombre de patients atteints
de la maladie divisé par la population totale à un moment précis. On peut
la voir comme une photographie fixe dans le temps pour décrire une
situation. Elle nous donne la probabilité qu'un participant soit atteint de
la maladie à un moment précis. La prévalence est élevée pour les maladies
fréquentes et pour celles qui durent longtemps. Ainsi, une maladie qui tue
rapidement comme un cancer agressif aura une prévalence plus faible qu'une
autre qui tue lentement. On peut aussi parler de la prévalence d'une
maladie pour un moment non fixe dans le temps mais fixe dans une vie. Par
exemple, on parlera de la prévalence d'anomalie congénitale à la naissance,
du taux d'une maladie à l'autopsie ou de la prévalence d'enfants non
vaccinés à l'entrée à l'école. Prévalence = Nombre de personne avec la maladie ou la condition X
Nombre de personne à risque de la maladie ou la
condition X L'incidence de la maladie permet d'ajouter la dimension temporelle au
calcul du ratio entre les cas et la population à risque. Il s'agit du
nombre de patients ayant développés la maladie pendant une période donnée
divisé par le nombre de participants à risque de développer la maladie. Le
dénominateur contient tout ET seulement les gens à risque; il exclut donc
les participants ayant déjà la maladie au début de la période de
surveillance ou ceux qui ne pourrons jamais avoir la maladie. Incidence : Nombre de nouveaux cas de la maladie ou condition X
Nombre de personnes à risque * période
de temps L'inclusion de patients qui n'ont aucun risque d'avoir la maladie dans le
dénominateur diminuera le taux mesuré de la maladie. Par exemple,
l'incidence de balanite paraîtra faussement basse dans les régions ou une
majorité de garçons sont circoncis car ceux-ci n'ont aucune chance de faire
une balanite. L'incidence n'est pas influencée par la durée de la maladie
parce qu'on mesure le taux de nouvelle maladie. Si le risque de développer
la maladie est constant dans le temps, les participants ne doivent pas
nécessairement être tous évalués pendant toute la durée de l'étude. Par
exemple, voici une étude sur le risque de pneumonie chez 6 enfants avec
FKP : Patients Début 3 mois 6 mois 9 mois
12 mois
Patient 1 -----------------------------------------------------------