Projet provisoire de Master BioSciences - ENS de Lyon

Demande d'Habilitation du Master « BioSciences » Ecole Normale Supérieure de Lyon et Université Claude Bernard Lyon 1 Projet élaboré par:
Chantal Rabourdin-Combe (Prof. UCB; rabourdin@cervi-lyon.inserm.fr)
et
Vincent Laudet (Prof. ENS; Vincent.Laudet@ens-lyon.fr) Novembre 2006
Sommaire Objectifs de la formation Page 3
Historique/Etat des lieux Page 3
Philosophie générale Page 3
Publics visés Page 4
Débouchés Page 4
Condition d'accès Page 4
Organisation générale Page 5
Organisation détaillée Page 6
UE obligatoires Page 6
UE de cours de S1 Page 6
UE "Europe" des semestres S2, S3, S4 Page 7
UE de stage de S2, S3, S4 du parcours recherche
Page 8
Ouverture européenne Page 8
Modalités de Contrôle des connaissances
Page 9
UE de cours de S1 Page 9
UE "Europe" de S2, S3 et S4 Page 9
Stages Page 9
Conditions d'attribution du diplôme du Master BioSciences.
Page 9
Evaluation des enseignements Page
11
Evaluation du Master Page
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Indicateurs de réussite Page
11
Définition de l'équipe pédagogique Page
11
Equipe de formation Page
11
Conseil de formation Page
11
Annexe 1 Page 12
Annexe 2: CVs des responsables d'UE Page
13
Annexe 3: Fiches de description de chaque UE Page
43
UE obligatoires Page 44
UE du premier semestre Page
48
UE "Europe" Page
58
Annexe 4: Fiche d'évaluation Page
67
Objectifs de la formation Historique/Etat des lieux
Le master BCMO a été crée lors du dernier contrat quadriennal (2003-2006).
Il regroupe les cursus antérieurement proposés par l'Ecole Normale
Supérieure de Lyon dans son magistère de Biologie Moléculaire et
Cellulaire, et par l'UCBL dans les mentions « Génétique Moléculaire et
Cellulaire » et « Microbiologie » de la maîtrise Biologie Cellulaire et
Physiologie, et intègre un nouveau cursus portant spécifiquement sur
l'Oncologie. Les cursus antérieurs aboutissaient, pour leur partie
« recherche », au même DEA de Différenciation - Génétique - Immunologie
(DGI) puis à la même école doctorale pour les étudiants restant a Lyon,
école doctorale BMIC (Biologie Moléculaire Intégrée et Cognitive). Le master BCMO a été organisé en deux « spécialités », Biologie
Moléculaire et Cellulaire d'une part et Génétique Fonctionnelle et
Oncologie d'autre part. Les UE de chaque spécialités sont ouvertes à tous
les étudiants du master sous réserve des prérequis spécifiques mais chaque
spécialité propose des durées de « formation générale » différentes avec
une entrée dans la formation à la recherche dès le S2 pour Biologie
Moléculaire et Cellulaire, le S3 pour Génétique Fonctionnelle et Oncologie. La spécialité Biologie Moléculaire et Cellulaire co-habilitée par l'ENS
et l'UCB comporte un semestre de formation générale, représentant 30
ECTS, suivi de 3 semestres, également équivalents à 30 ECTS chacun,
construits autour d'un stage en laboratoire important (24 ECTS) auquel
est adjoint un enseignement sous forme de cours magistraux et/ou de
séminaires pour 6 ECTS. Elle implique qu'une base de connaissances très
solide ait été acquise antérieurement. Elle est sous la responsabilité de
l'ENS de Lyon
La spécialité Génétique Fonctionnelle et Oncologie co-habilité par
l'UCB propose pour les 2 premiers semestres, un socle de 5 UE communes à
tous les étudiants, pour 30 ECTS; les 30 autres crédits du M1 seront
obtenus soit à partir du portefeuille d'UE offert pour l'ensemble du
master BCMO. Les 2 semestres de M2 comportent chacun un stage de longue
durée (24 ECTS) et une UE (6 ECTS). Cette spécialité Génétique
Fonctionnelle et Oncologie est sous la seule responsabilité de l'UCBL. Au cours de ce mandat, il est apparu que cette organisation devait être
revue par manque de visibilité. En effet, l'intitulé des ces deux
spécialités ne reflètent pas les différences d'objectif existant. Par
exemple, un des objectifs contractuel de l'ENS est de faire essaimer 70% de
ses effectifs d'élèves vers des laboratoires extérieurs à son environnement
pour effectuer une thèse; la mobilité étant considérée comme un élément
très positif de la formation, il en est de même pour les étudiants non
normaliens qui choisissent le « cursus » BMC. Dans ce contexte, l'équipe
pédagogique de la spécialité BMC a favorisé les échanges internationaux en
mettant en place un nombre limité d'UE de haut niveau accessibles tant aux
étudiants inscrits dans ce master qu'aux étudiants extérieurs, et en
particulier ceux provenant d'autres pays de l'Union Européenne. Ces UE
dites « Europe », au nombre de six, sous forme de séminaires donnés en
anglais ont rencontré un grand succès car de nombreux chercheurs ont
participé à la réalisation de ces UE , ce qui a permis de faire participer
des intervenants de très grande renommée
Le bilan de l'activité de la spécialité Biologie Moléculaire et Cellulaire
co-habilitée par l'ENS et l'UCB est présentation dans le tableau en annexe
1
Philosophie générale
L'objectif de la formation du Master Biosciences est d'offrir une
formation de haut niveau à et par la recherche. A terme, le Master
Biosciences sera un Master du PRES de Lyon et l'enseignement qui y sera
dispensé couvrira les champs majeurs de la biologie moderne. Son offre de
formation le différencie des Masters portés par les différents
établissements du PRES qui sont des Masters de spécialités comme, par
exemple, « Génétique et Biologie Cellulaire », « Biochimie »,
« Physiologie et Neurosciences », « Approches Mathématiques du Vivant »,
« Epidémiologie », « Ecologie, Ecologie Microbienne, Evolution ». Les thématiques enseignées dans ce Master couvriront un champ très large
allant de l'organisation du noyau à la biodiversité tant au niveau des
procaryotes que des eucaryotes en passant par l'étude de l'organisme à un
niveau intégré (physiologie, ouvertures vers les sciences de la santé).
Ce type d'enseignement permettra une meilleure compréhension du
développement d'un organisme qu'il soit végétal ou animal et permettra
d'acquérir des compétences requises actuellement pour mener à bien tout
projet de recherche en biologie, quelque soit le champ disciplinaire
concerné. En résumé, l'objectif de cet enseignement est plus tourné vers
une pratique de la critique scientifique que vers la maîtrise d'un
domaine particulier. Toutefois, l'organisation du Master Biosciences
permet, à l'étudiant qui le désire, de se spécialiser dans une thématique
via le choix d'UE et de stages adéquats. Cet enseignement s'appuiera sur une recherche fondamentale d'amont, sur
la compétence d'enseignants-chercheurs et de chercheurs reconnus dans
leur domaine de recherche et favorisera le transfert du savoir tant au
niveau des concepts les plus récents que des approches technologiques
innovantes. Le programme comportera des enseignements « classiques » sous
forme de cours et de travaux dirigés, des enseignements demandant un
travail personnel conséquent et des enseignements sous formes de
conférences avec une forte participation de chercheurs européens. Le
Master « BioSciences » met l'accent sur l'initiation à la recherche, avec
une part importante de stages en laboratoires de recherche. Cette
initiation sera propre à chaque étudiant et tous seront fortement
encouragés à la mobilité durant ces trois semestres. En aucun cas,
l'étudiant ne pourra effectuer plus de deux des trois semestres concernés
dans le même laboratoire.
Publics visés Ce Master s'adresse aux étudiants issus de Licence de Biologie, aux
étudiants des écoles d'ingénieurs, aux étudiants en Médecine, Pharmacie,
Vétérinaires et aux étudiants étrangers désireux de se former à et par la
recherche.
Effectif maximal du Master : 60 étudiants, avec pour objectif 30
normaliens/30 auditeurs.
Note : compte tenu du parcours spécifique des médecins, pharmaciens et
vétérinaires, les modalités d'inscription et d'obtention du Master
BioSciences sont aménagées (cf paragraphe « conditions d'obtention du
diplôme du Master BioSciences » p.9). Débouchés
La réalisation d'une thèse, dans un laboratoire académique ou dans un
laboratoire industriel, pour traiter des questions fondamentales ou
app