Les mycoses - microbiologie - Free

Sur plus de 200 000 espèces de champignons, seule une petite centaine est ...
par les champignons, les aflatoxines produites par les Aspergillus par exemple).
... Les mycoses sous-cutanées sont dues à des champignons saprophytes du sol
, ... L'examen clinique du patient doit être mis en relation avec les analyses ...

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Les mycoses
Sur plus de 200 000 espèces de champignons, seule une petite centaine est
impliquée dans des maladies humaines. On distingue les mycoses (infections
fongiques) des mycotoxicoses (intoxications liées à des toxines produites
par les champignons, les aflatoxines produites par les Aspergillus par
exemple). 1. Classification des mycoses
1. Les mycoses superficielles
Les mycoses superficielles concernent la peau (dermatophyties) et les
phanères (cheveux et poils : teignes ; ongles : onyxis). Les champignons
impliqués sont des dermatophytes (Trichophyton, Microsporum,
Epidermophyton)ou des levures (Candida, Malassezia furfur, Trichosporon).
. Dermatophytoses
Les dermatophytes s'attaquent à la kératine. Leur installation est
favorisée par la chaleur et l'humidité, un manque d'hygiène, l'immuno-
dépression...
L'herpès circiné, transmis par les animaux (Microsporum canis), par l'homme
(Trichophyton rubrum), ou par la terre (Trichophyton mentagrophytes) forme
des taches circulaires avec une croûte en bordure.
L'eczéma marginé de Hébra concerne les replis de la peau tandis que
l'intertrigo des espaces interdigitaux sont des mycoses des mains et des
pieds (« pied d'athlète »). Les espèces en cause sont Trichophyton rubrum
et Epidermophyton floccosum.
Les dermatophytes infectant le cuir chevelu entraînent la formation de
squames et de plaques d'alopécie :
- type tondante microsporique : une grande plaque d'alopécie,
fluorescence verte sous UV, le cheveu est entouré de microspores
(Microsporum audouinii, M. langeroni, M. canis) ;
- type tondante trichophytique : nombreuses petites plaques d'alopécie,
pas de fluorescence sous UV, sporulation dans le cheveu (Trichophyton
tonsurans, T. violaceum, T. soudanense) ;
- type favique avec attaque du follicule pileux conduisant à de grandes
plaques d'alopécie définitive et des croûtes friables jaunâtres sur le
cuir chevelu. (Trichophyton schoenleinii) ;
- type inflammatoire (ou kérions) avec suppuration, pus et croûtes.
(Trichophyton mentagrophytes, T. verrucosum...) atteignant
particulièrement barbe, moustache et sourcils.
Trichophyton rubrum et T. interdigitale peuvent envahir les ongles
(onychomycose). . Candidoses
Le genre Candida comprend des espèces saprophytes du milieu extérieur ou
commensales des muqueuses et de la peau chez l'homme et l'animal. Une
vingtaine d'espèces appartenant au genre Candida sont régulièrement isolées
chez l'homme. C. albicans est l'espèce la plus fréquente : c'est une levure
de la flore digestive normalement absente de la flore cutanée. Parmi les
autres espèces, on trouve : C. glabrata, C. tropicalis, C. parapsilosis, C.
krusei. Les Candida sont des levures opportunistes, ne devenant pathogènes
qu'en présence de facteurs favorisants. Les atteintes superficielles sont
les suivantes :
- intertrigo ;
- périonyxis (tuméfaction rouge douloureuse entourant la base de
l'ongle) et onyxis ;
- candidoses génitales (vulvo-vaginites, balanite) ;
- érythème fessier du nourrisson ;
- candidoses buccales (« muguet ») et oesophagiennes. . Pityriasis versicolor
Malassezia furfur est une levure lipophile, faisant partie de la flore
cutanée normale. Elle peut provoquer, à la faveur de circonstances
favorisantes (chaleur, humidité, grossesse, SIDA...), la pityriasis
versicolor, mycose caractérisée par des taches de couleur jaune à brun sur
le tronc, les membres, le cou... 2. Les mycoses sous-cutanées
Les mycoses sous-cutanées sont dues à des champignons saprophytes du sol,
incapables de traverser la peau. Ils pénètrent dans le tissu cutané au
niveau d'une plaie souillée par de la terre, du bois...
. Chromomycose (ou chromoblastomycose)
C'est une mycose tropicale caractérisée par un aspect verruqueux au niveau
des membres. Quelques espèces en sont responsables :
- Phialophora verrucosa
- Fonsecaea pedrosoi
- Cladosporium (Cladophialophora) carrionii
La dissémination de ces micro-organismes par voie lymphatique est possible. . Sporotrichose
La sporotrichose est causée par le champignon dimorphique Sporothrix
schenckii. L'inoculation est généralement d'origine traumatique. Les
nodules produits peuvent s'ulcérer, permettant ainsi aux germes de
disséminer dans l'organisme. 3. Les mycoses profondes (ou systémiques)
Les champignons responsables de mycoses profondes sont souvent
dimorphiques : la phase saprophyte est mycélienne tandis que la phase
parasitaire est de type levure (Histoplasma, Blastomyces, Coccidioides,
Sporothrix). La contamination s'effectue généralement par voie respiratoire
(inhalation de spores). Après le stade pulmonaire, l'infection peut se
propager dans le sang (mycose septicémique) et/ou les organes profonds
(mycose viscérale, mycose disséminée). . Candidose
La candidose disséminée peut être causée par les lésions des muqueuses, les
injections de stupéfiants non stériles, les cathéters... La dissémination
hématogène des Candida peut entraîner des lésions des reins, de la rate,
des poumons, du foie... Si C. albicans est impliqué dans 95 % des mycoses
superficielles, il n'est isolé que dans la moitié des candidoses profondes.
C. glabrata, C. tropicalis et C. parapsilosis sont les autres espèces en
cause. Les candidémies peuvent être fatales (mortalité élevée), leur
diagnostic doit donc être précoce chez les patients à risque. Les Candida
sont des agents pathogènes nosocomiaux importants. . Cryptococcose
Cryptococcus neoformans est une levure capsulée responsable de méningites.
Il s'agit d'une mycose fréquente chez les patients atteints du SIDA. Il
existe trois variants. En Europe, C. neoformans var. neoformans est
retrouvée dans les fientes des pigeons. . Aspergillose
Les Aspergillus sont des moisissures omniprésentes dans l'environnement, se
développant sur des débris organiques (dans le sol, les céréales...). Leurs
conidiospores se retrouvent facilement dans l'air et peuvent donc être
inhalées. Les infections pulmonaires sont les plus fréquentes mais d'autres
localisations sont possibles (otites, sinusites). A partir du foyer
pulmonaire, le mycète peut se répandre et entraîner une aspergillose
disséminée. Aspergillus fumigatus et A. flavus sont les espèces les plus
fréquemment en cause. . Zygomycoses
Les Mucorales (Mucor, Absidia, Rhizopus, Rhizomucor) et les Entomophtorales
sont des Zygomycètes pouvant être responsables d'affections cutanées,
pulmonaires ou cérébrales. Les Mucorales, cosmopolites, sont impliquées
dans des infections opportunistes chez les transplantés, les diabétiques,
les leucémiques, les grands brûlés... . Histoplasmose
On distingue l'histoplasmose américaine (Histoplasma capsulatum) et
l'histoplasmose africaine (Histoplasma duboisii). Seule la première est une
infection opportuniste au cours du SIDA. Le champignon est retrouvé dans
les excréments des oiseaux et des chauves-souris. La primo-infection
pulmonaire peut évoluer vers la forme disséminée. . Blastomycose
Blastomyces dermatitidis est un mycète dimorphe du sol. La primo-infection
touche les poumons ou la peau. L'évolution vers les atteintes secondaires
(viscérales, osseuses) est lente.
. Coccidioidomycose
Coccidioides immitis est un mycète dimorphe des régions désertiques
américaines produisant des arthrospores, qui peuvent être inhalées. La
forme pulmonaire est quasiment asymptomatique (type grippal), mais la forme
disséminée secondaire peut s'avérer fatale. 2. Diagnostic
L'examen clinique du patient doit être mis en relation avec les analyses
réalisées au laboratoire. L'identification d'un champignon repose
principalement sur sa morphologie, observée directement à partir du
prélèvement ou après culture sur un milieu approprié. Des galeries
miniaturisées permettent l'identification des levures, grâce à leurs
caractères biochimiques. Des techniques immunologiques sont également
utilisées.
1. Prélèvements
. Peau et phanères
Les squames (après grattage), les cheveux, les poils et les ongles coupés
sont recueillis dans des boites de Pétri stériles (par exemple). Dans le
cas des lésions suintantes, le prélèvement est réalisé par écouvillonnage
ou par ponction.
. Expectorations et lavages bronchoalvéolaires
. Sang
. LCR
. Urines
. Selles
. Biopsies 2. Examen microscopique direct
Un état frais sans coloration ou avec (bleu coton, encre de Chine pour la
mise en évidence de la capsule de Cryptococcus neoformans) permet d'établir
une orientation du diagnostic et d'estimer le nombre d'éléments fongiques
présents dans le prélèvement. Un éclaircissement à la potasse ou au
lactophénol est nécessaire pour les prélèvements contenant de la kératine
(recherche de dermatophytes). 3. Culture
Les milieux d'isolement des champignons (gélose à l'extrait de malt, milieu
de Sabouraud) conviennent à la plupart des espèces, mais certaines d'entre-
elles sont exigeantes (Histoplasma, Trichophyton ochraceum). La flore
bactérienne peut être éliminée par l'ajout d'antibiotiques
(chloramphénicol, gentamicine), tandis que la flore fongique commensale
peut être inhibée par la présence d'actidione (cycloheximide). Les milieux
sont conditionnés en tubes à essais.
La tempér