UE

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|UE : |quantification et modelisation en biologie |Semestre S2 |
|Image et Biologie| | |
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|(M2) | | |
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|ECTS : 3 |COURS |TD | | |Total |
| |INTEGRES |26 h | | |d'heures |
| |13 h | | | |60h |
|Responsables : POULAIN Bernard (DR,CNRS)| |
|Discipline :Neurosciences, UPR2356, |Module au choix : OUI |
|Laboratoire de la Neurotransmission et | |
|sécrétion neuroendocrine, 5, rue Blaise | |
|Pascal 67084, Strasbourg, Tél : 03 88 45| |
|66 77 Fax : 03 88 60 16 64, Mail : | |
|poulain@neurochem.u-strasbg.fr | |
|RODEAU Jean-Luc, (CR,CNRS), | |
|Discipline : Neurosciences, UMR7519, | |
|Laboratoire de Neurophysiologie | |
|cellulaire et intégrée, 21, rue René | |
|Descartes, 67084, Strasbourg, Tél : 03 | |
|90 24 14 61 Fax : 03 88 61 33 47 Mail : | |
|jlr@neurochem.u-strasbg.fr | |
|Pré-requis : Connaissances générales en biologie. |
|OBJECTIFS DE L'ENSEIGNEMENT |
|Etude des relations entre un paramètre physique ou chimique identifié et/ou |
|quantifié et l'évènement biologique correspondant. Elaboration de modèles |
|biologiques, étude de leur valeur au plan prédictif et de leur intérêt pour la |
|connaissance du système biologique étudié. Etude critique des valeurs |
|expérimentales obtenues. |
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|PROGRAMME DETAILLE : |
|Chap. I.- MODELISATION EN BIOLOGIE |
|Chap. II.- ANALYSE DYNAMIQUE DES SYSTEMES COMPARTIMENTES |
|Chap. III.- ANALYSE DES SYSTEMES A L'EQUILIBRE |
|Chap.IV.- AJUSTEMENT DE MODELES AUX DONNEES EXPERIMENTALES |
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|APPLICATIONS (TD ou TP) |
|Voir volumes horaires ci-dessus. |
|Etude de cas pratiques |
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|COMPETENCES ACQUISES |
|Apprendre à acquérir et quantifier des données biologiques, à analyser ces |
|données, à élaborer un modèle descriptif, interprétatif et prédictif. Maîtriser|
|les outils conceptuels et logiciels (modélisation, simulation) nécessaires à la|
|mise en ?uvre de ces modèles. |
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|Dispositif d'évaluation des enseignements et modalités d'examen : |
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|Contrôle continu (3/4) ; contrôle terminal (1/4) |
| | |TRANCHE |Titre de l'enseignement |Code matière|
|2A |Ingénierie et sciences physiques du vivant | |
|ISPV | |? |
|ECTS |COURS |TD |TP |Projet |Total |
|? |25h |/ |TPE |/ |d'heures |
| | | | | |25h |
|Responsable : |Enseignants : |
|Baumgartner Daniel |Baumgartner Daniel |
|Pré-requis : |
|Notions de mécanique tensorielle. |
|OBJECTIFS DE L'ENSEIGNEMENT |
|Acquérir les outils nécessaires à la modélisation de la continuité entre |
|l'inerte, le vivant et le mental. |
|Illustrer la pertinence des méthodes classiques de l'ingénieur pour |
|appréhender le vivant et le mental. |
|Donner un aperçu des métiers liés à la maîtrise de cette double compétence |
|physique et vivant. |
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|PROGRAMME DETAILLE |
|La vie, c'est le mouvement (Eléments de mécanique des milieux continus - |
|Application de la mécanique des milieux continus à la statique des |
|structures (dans le cadre de la théorie des poutres) et à la dynamique des |
|structures (dans le cadre de l'analyse en vibrations de structures telles |
|les os longs : fémur, humérus ...) - Eléments d'analyse modale, de |
|fonctions de transferts et de signature mécanique d'une structure - |
|Exemples d'élasticité linéaire par les méthodes variationnelles et |
|application à la déformation en flexion-extension, tension-compression et |
|torsion de milieux continus tels les os longs - Autres exemples de tissus |
|vivants appréhendés sous l'angle de la biomécanique musculaire squelettique|
|des chocs et des vibrations : tête, colonne cervicale ... - Eléments |
|d'ergonomie et de biomécanique du sport - Eléments de protection contre les|
|chocs et les impacts). |
|L'outil numérique (Introduction à la résolution de problèmes de mécanique |
|par la méthode des éléments finis - Eléments d'analyse numérique - |
|Mécanique numérique). |
|Traitement de l'information par le vivant, et métrologie du vivant et du |
|mental (Description de la métrologie sensorielle - Analyse de la perception|
|- Exemple de capteur d'accélération pour la transformation mécano-neurale |
|d'information : les canaux semi-circulaires et les otolithes - Exemple de |
|contrôle neurologique - Exemple de contrôle adaptatif - Eléments de |
|cognition et comparaison avec les outils de l'intelligence artificielle). |
|Un domaine en plein développement : la chirurgie virtuelle (Principes |
|généraux - Apports du traitement d'image - Apports de la mécanique des |
|milieux continus - Apports de l'automatique). |
|Imagerie fonctionnelle (Physique d'un imageur - Physique d'un processus |
|vivant analysé - Problèmes d'interprétations). |
|Physiologie (Eléments de physiologie du système nerveux central chez les |
|vertébrés). |
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|APPLICATIONS (TPE) |
|Réalisation de modèles par éléments finis simples à l'aide du logiciel de |
|maillage HYPERMESH et du code de calcul RADIOSS CRASH. |
|Problèmes liés à la cognition. |
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|COMPETENCES ACQUISES |
|Maîtrise des outils nécessaires à la modélisation de la continuité entre |
|l'inerte, le vivant et le mental. |
|Connaissance des méthodes classiques de l'ingénieur pour appréhender le |
|vivant et le mental. |
|Connaissance des métiers liés à la maîtrise de cette double compétence |
|physique et vivant. |
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|BIBLIOGRAPHIE |
|/ | | | | |
|UE : |Notions pratiques d'analyse et de traitement|Semestre S1 |
|Image et |d'images | |
|microscopie